二零一六年三月，師父陳大明患病去世，冷小兵(肖央 飾)因?yàn)橐黄鸢讣t到，等他抵達(dá)陵園時(shí)，師娘已在其他警員的攙扶下離開(kāi)。如今上級(jí)向市局下達(dá)明確指令，決定將海舟案移交回省廳調(diào)查，但是在冷小兵看來(lái)，時(shí)隔二十七年的迷霧尚未撥開(kāi)，只要一日未見(jiàn)光明，他便多一日負(fù)罪感，永遠(yuǎn)追查下去。
可惜到現(xiàn)在為止，海舟案依舊是個(gè)深不見(jiàn)底的窟窿，吞噬著每個(gè)人的希望，還會(huì)讓人對(duì)這種不可預(yù)知的黑暗感到迷茫且恐慌。陳大明臨終之前尚有遺憾，后悔不該將冷小兵牽扯進(jìn)來(lái)，于是便將冷小兵托付給高鵬(常鋮 飾)，希望他能盡快幫助師弟走出陰影。
原本高鵬認(rèn)為冷小兵不再接觸海舟案，一切交給時(shí)間便可，直到夏木(董子健 飾)的出現(xiàn)，宛如一顆石子拋向大海，便不再是風(fēng)平浪靜。夏木以優(yōu)秀成績(jī)從警校畢業(yè)，深受省廳刑偵周處長(zhǎng)的賞識(shí)，按理說(shuō)應(yīng)該會(huì)有更好選擇，可他偏要申請(qǐng)調(diào)到市局重案組。
因?yàn)橄哪镜膱?jiān)持，引起了高鵬的懷疑，正要去找冷小兵商量，怎料冷小兵接到報(bào)警，急急忙忙打斷高鵬要說(shuō)的話，順便帶上夏木前往案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)。死者馬煜在當(dāng)?shù)貎x表廠工作，人際關(guān)系較為簡(jiǎn)單，經(jīng)常會(huì)去森林公園爬山。根據(jù)警方初步推斷，馬煜死于機(jī)械性窒息，頸部勒痕明顯，生前遭人電擊，時(shí)間大概是在昨天夜里。
現(xiàn)場(chǎng)僅有兩處腳印，除了死者以外，另外一處腳印為三十九碼，說(shuō)明兇手極有可能是女性。起初冷小兵認(rèn)定為情殺所致，怎料夏木卻對(duì)此案有不同看法，憑靠馬煜死狀分析兇手作案心理，更多偏向于仇殺的可能性，甚至想通過(guò)這種方式讓死者為某件事情道歉，在實(shí)施之前就精心部署。
夏木思維縝密，推理得頭頭是道，很快贏得冷小兵的好感，邀請(qǐng)他上車一起回警隊(duì)。然而在半路得知夏木的身份，冷小兵大為詫異，急忙跑去質(zhì)問(wèn)高鵬，賭氣辭去隊(duì)長(zhǎng)。高鵬同樣感到惱火，忍不住將他訓(xùn)斥一番，倘若夏木當(dāng)真是帶著仇恨回來(lái)調(diào)查海舟案，更應(yīng)該將對(duì)方留在重案組，以便于監(jiān)視。
警方傳喚死者妻子來(lái)做筆錄，夏木趁機(jī)與小男孩聊天，通過(guò)他得知馬煜生前有個(gè)很大的登山包。可在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)，警方并未找到此包，反倒是馬太太神色舉止反常，引起冷小兵的懷疑。待家屬離開(kāi)后，夏木跟著冷小兵來(lái)到驗(yàn)尸房，看著法醫(yī)解剖尸體的畫面，忽然感覺(jué)不適，眼前浮現(xiàn)出夏金蘭(高露 飾)慘死的片段，甚至出現(xiàn)幻覺(jué)，靠著服用藥物才逐漸平復(fù)。
到了下班之后，冷小兵以順道為由，開(kāi)車送夏木回家，發(fā)現(xiàn)他竟住在印刷廠家屬院，心里有些不是滋味。夏木改變主意，提出要去老廠區(qū)看看，此時(shí)的老廠區(qū)早已荒廢，象征著十七年光陰如梭，物是人非。盡管過(guò)去那么久，夏木依然想不通冷小兵為何遲遲未對(duì)兇手開(kāi)槍，如果開(kāi)了槍，或許夏金蘭不會(huì)死，正因當(dāng)時(shí)沒(méi)開(kāi)槍，他才好奇夏金蘭死得是否痛苦。
當(dāng)天晚上，冷小兵給高鵬打電話匯報(bào)進(jìn)展，表示夏木暫且看似沒(méi)有任何問(wèn)題，僅問(wèn)了一個(gè)令他良心備受譴責(zé)的問(wèn)題。冷小兵向夏木隱瞞了夏金蘭的真正死因，他知道夏金蘭并非當(dāng)場(chǎng)斃命，而是飽受割腕放血的痛苦煎熬，在長(zhǎng)達(dá)十幾分鐘里，眼睜睜感受著死亡的滋味。
而在另一邊，高鵬坐在辦公室里沉思，反復(fù)回想著師父的臨終囑托，正陷入兩難遲疑，忽然接到秦局的電話，得知省廳針對(duì)于命案必破的綱領(lǐng)，準(zhǔn)備重啟積案展開(kāi)調(diào)查，給所有老百姓和死者家屬一個(gè)滿意的答復(fù)。趁著這次機(jī)會(huì)，高鵬主動(dòng)申請(qǐng)成立專案組。
與此同時(shí)，冷小兵像是下定決心般，拾起斧頭砸開(kāi)書房的門鎖，書房里全是他近些年所收集的各種線索。反觀夏木獨(dú)自回到家中，白板上一張地圖，幾位受害者名字，不約而同地引導(dǎo)著三個(gè)人作出選擇，仿佛一股無(wú)形的力量，默默洞察著他們的靈魂和思想。
